Ở người, CD19 được mã hóa bởi gen 7,19 kilobase CD19 nằm trên vai ngắn của nhiễm sắc thể 16.[7][8] Gen này chứa ít nhất mười lăm exon, bốn mã hóa cho miền ngoại bào và chín mã hóa các miền trong tế bào chất, với tổng số 556 axit amin.[8] Các thử nghiệm cho thấy có nhiều phiên bản của mRNA; tuy nhiên, ta mới chỉ phân lập được hai trong số đó ở cơ thể.[7]

CD19 là một glycoprotein xuyên màng I loại 95 kd trong họ siêu globulin (IgSF) với hai miền giống-Ig bộ C2 ở ngoại bào và một đuôi tế bào chất tương đối lớn, gồm 240 axit amin, được bảo tồn cao trong các loài động vật có vú.[7][9][10][11]Miền giống-Ig bộ-C2 ngoại bào được chia thành một miền có tiềm năng liên kết với disulfide không-giống-Ig và các vị trí bổ sung carbohydrate với liên kết N.[7][12] Đuôi trong tế bào chất chứa ít nhất chín chuỗi bên tyrosine gần đầu kết thúc C.[7] Trong các chuỗi bên này, Y391, Y482 và Y513 được chứng minh là cần thiết đối với các chức năng sinh học của CD19.[13] Phenylalanine thay thế cho tyrosine tại Y482 và Y513 dẫn đến sự ức chế phosphoryl hóa ở các tyrosine khác.[6][14]